Projektowani

Yockey, Hubert P., 2005- Information Theory, Evolution, and the Origin of Life

Pełny widok tekstowy: wszystkie sekcje są rozwinięte i znajdują się w jednym dokumencie HTML.

Autor / redaktor
Hubert P. Yockey
Tytuł
Information Theory, Evolution, and the Origin of Life
Rok
2005
Identyfikator
yockey-hubert-p-information-theory-evolution-and-the-origin-of-life
Źródło / uwaga
Import z PROJEKTOWANI v11. Status redakcyjny: opis bibliograficzny kompletny lub rozpoznany w istniejącej bazie.

Opis bibliograficzny

Hubert P. Yockey, Information Theory, Evolution, and the Origin of Life, Cambridge University Press 2005, ISBN 978-0-521-80293-2 (wydanie w twardej oprawie wskazane w metryce).

Zakres dostępnej kopii

435 stron PDF w układzie eksportu z czytnika, ze wskaźnikami „Loc” i postępu oraz niejednorodną paginacją. Rok 2005 jest potwierdzonym rokiem pierwszego wydania, nie ustaloną datą wykonania pliku. Obecne są przedmowa, wszystkie 13 rozdziałów, epilog kończący się na PDF 328, dodatek matematyczny od PDF 329, słownik od PDF 365, bibliografia PDF 372–423, indeks PDF 424–432, dwie końcowe noty PDF 433–434 i tylna okładka PDF 435. Nie stwierdzono braku końcowych części zapowiedzianych w spisie, ale nie przeprowadzono kolacji każdej strony. Widoczne są błędy rozpoznania tekstu, także w nagłówkach i zapisie wzorów.

Streszczenie treści

Yockey przedstawia zastosowanie teorii informacji i kodowania do biologii molekularnej, dziedziczenia oraz ewolucji. Wyjaśnia cyfrowy charakter informacji genetycznej, historię rozpoznania kodu, centralny dogmat biologii molekularnej i przekazywanie sekwencji od DNA przez RNA do białek. Rozważa ilościowe miary informacji, redundancję, błędy transmisji oraz porównywanie rodzin białek i ewolucję kodu genetycznego. Dalsze rozdziały krytycznie analizują scenariusze początku życia, koncepcję pierwotnej zupy, witalizm, hipercykle oraz katastrofę błędów Eigena. Autor odróżnia przypadkowość, uporządkowanie i złożoność, korzystając także z algorytmicznej teorii informacji i zagadnień rozstrzygalności. Utrzymuje, że początek życia jest niepoznawalny, lecz nie traktuje tego jako argumentu za inteligentnym projektantem. Wyraźnie broni ewolucji i polemizuje z argumentem nieredukowalnej złożoności. Dodatek matematyczny, słownik, obszerna bibliografia i indeks pomagają odnaleźć terminologię oraz podstawy wywodu. Publikacja jest monografią naukową z filozoficznymi interpretacjami autora; nie należy opisywać jej jako obrony inteligentnego projektu.

Hasła tematyczne

teoria informacji; Hubert P. Yockey; biologia molekularna; informacja genetyczna; DNA i RNA; kod genetyczny; centralny dogmat biologii molekularnej; entropia Shannona; redundancja; rodziny białek; ewolucja; pochodzenie życia; katastrofa błędów; algorytmiczna teoria informacji; granice poznania; krytyka inteligentnego projektu

Omówienie źródła

Autor / redaktor: Yockey, Hubert P.
Tytuł: Information Theory, Evolution, and the Origin of Life
Identyfikator: yockey-hubert-p-information-theory-evolution-and-the-origin-of-life
Źródło w pierwotnych plikach: pozycje szczegółowe

Contents

Preface

  1. The genetic information system
  2. James Watson, Francis Crick, George Gamow, and the genetic code
  3. The Central Dogma of molecular biology
  4. The measure of the information content in the genetic message
  5. Communication of information from the genome to the proteome
  6. The information content or complexity of protein families
  7. Evolution of the genetic code and its modern characteristics
  8. Haeckel’s Urschleim and the role of the Central Dogma in the origin of life
  9. Philosophical approaches to the origin of life
  10. The error catastrophe and the hypercycles of Eigen and Schuster
  11. Randomness, complexity, the unknowable, and the impossible
  12. Does evolution need an intelligent designer?
  13. Epilogue

Mathematical appendix

Glossary

References

Index

Spis treści

Pełny oryginalny spis na PDF 7–8, sprawdzony wizualnie. Połączono łamane wiersze i pominięto stopki czytnika; źródłowy spis nie podaje numerów stron. Zachowano widoczne w tej kopii kropki między nazwiskami w pozycji 2 i zapis „modem” w pozycji 7. Nagłówek rozdziału 7 w treści na PDF 160 brzmi „Evolution of the genetic code and its modern characteristics”. Nie rozszerzano spisu o podrozdziały odnalezione jedynie w tekście.

Contents
Preface
1 The genetic information system
2 James Watson. Francis Crick. George Gamow, and the genetic code
3 The Central Dogma of molecular biology
4 The measure of the information content in the genetic message
5 Communication of information from the genome to the proteome
6 The information content or complexity of protein families
7 Evolution of the genetic code and its modem characteristics
8 Haeckel’s Urschleim and the role of the Central Dogma in the origin of life
9 Philosophical approaches to the origin of life
10 The error catastrophe and the hypercycles of Eigen and Schuster
11 Randomness, complexity, the unknowable, and the impossible
12 Does evolution need an intelligent designer?
13 Epilogue
Mathematical appendix
Glossary
References
Index

Fiszki (5)

PV11-103 — R14: Information Theory, Evolution, and the Origin of Life — przypis 103

Stały link do fiszki
Priorytet: BrakMiejsce: nieprzypisane

Czytam autora

Fragment źródłowy w kontekście

Hubert P. Yockey, Information Theory, Evolution, and the Origin of Life (Cambridge
University Press, 2005), s. x (Przedmowa). Yockey zaznacza, że system genetyczny
jest cyfrowy i liniowy, co pozwala zastosować teorię informacji Shannona i mierzyć
zawartość informacji w genomach – jest to niezbędne do pełnego zrozumienia natury
i pochodzenia życia.

Lokalizacja w źródle

Projektowani v11, rozdział 14 „Mikrokosmos”, s. 133, przypis 103

Rozumiem fragment

Ważne zastrzeżenie

Przed ostatecznym drukiem porównać cytat i numer strony z egzemplarzem źródłowym.

Zaplecze redakcyjne

Jak wykorzystać w tekście

dla funkcjonowania życia. To nie magia ani przenośnia – to obiektywnie istniejący element świata ożywionego. Ba, da się ją zmierzyć i policzyć! Biolodzy, tacy jak Hubert Yockey, stosują w genomice teorię informacji rodem z matematyki. Skoro DNA to ciąg symboli (czteroliterowy, ale zawsze), można określać ile „bitów” informacji zawiera gen czy cały genom103 . Dzięki temu biologia z

Słowa kluczowe

Projektowani v11; rozdział 14; przypis 103; yockey-information; opracowanie

Opublikowane głosy / osobny formularzMożesz też zaznaczyć fragment podczas lektury, dopisać komentarz i wysłać wszystkie uwagi razem.

PV11-114 — R15: Information Theory, Evolution, and the Origin of Life — przypis 114

Stały link do fiszki
Priorytet: BrakMiejsce: nieprzypisane

Czytam autora

Fragment źródłowy w kontekście

Hubert P. Yockey, Information Theory, Evolution, and the Origin of Life, Cambridge
2005, s. 1–2. (Yockey wskazuje, że genetyka ma charakter cyfrowy i językowy –
DNA to linearny, cyfrowy kod, podobny do algorytmicznego języka komputerowego,
co umożliwia ilościowe, a nie tylko opisowe, badanie zjawisk życia.)

Lokalizacja w źródle

Projektowani v11, rozdział 15 „Informacja”, s. 143, przypis 114

Rozumiem fragment

Ważne zastrzeżenie

Przed ostatecznym drukiem porównać cytat i numer strony z egzemplarzem źródłowym.

Zaplecze redakcyjne

Jak wykorzystać w tekście

itp. Takie zestawienie wygląda jak sekretny szyfr z powieści – i faktycznie, odkrycie go było jednym z triumfów nauki. Hubert Yockey, fizyk i teoretyk informacji, poszedł krok dalej: wskazał, że informacja genetyczna choć zapisana w materii, sama materialna nie jest.

Słowa kluczowe

Projektowani v11; rozdział 15; przypis 114; yockey-information; opracowanie

Opublikowane głosy / osobny formularzMożesz też zaznaczyć fragment podczas lektury, dopisać komentarz i wysłać wszystkie uwagi razem.

PV11-144 — R17: Information Theory, Evolution, and the Origin of Life — przypis 144

Stały link do fiszki
Priorytet: BrakMiejsce: nieprzypisane

Czytam autora

Fragment źródłowy w kontekście

Hubert P. Yockery, Information theory, evolution, and the origin of life, New York,
Cambridge University Press 2005, loc. 2097: “ Possibly the first enzyme was an RNA
molecule with replicase properties.” The discovery of ribozymes, in which RNA plays
both roles, namely, that of recording and transfer of information and the catalysis role
of enzymes proved this prophetic”.

Lokalizacja w źródle

Projektowani v11, rozdział 17 „Początek życia”, s. 164, przypis 144

Rozumiem fragment

Ważne zastrzeżenie

Przed ostatecznym drukiem porównać cytat i numer strony z egzemplarzem źródłowym.

Zaplecze redakcyjne

Jak wykorzystać w tekście

przemianami – czyli stanowić pierwszy, samowystarczalny system o cechach życia.

Słowa kluczowe

Projektowani v11; rozdział 17; przypis 144; yockey-information; opracowanie

Opublikowane głosy / osobny formularzMożesz też zaznaczyć fragment podczas lektury, dopisać komentarz i wysłać wszystkie uwagi razem.

PV11-148 — R17: Information Theory, Evolution, and the Origin of Life — przypis 148

Stały link do fiszki
Priorytet: BrakMiejsce: nieprzypisane

Czytam autora

Fragment źródłowy w kontekście

Hubert P. Yockery, Information theory, evolution, and the origin of life, New York,
Cambridge University Press 2005, loc. 2104: ” This does not lead in the direction of
the origin of life”.

Lokalizacja w źródle

Projektowani v11, rozdział 17 „Początek życia”, s. 165, przypis 148

Rozumiem fragment

Ważne zastrzeżenie

Przed ostatecznym drukiem porównać cytat i numer strony z egzemplarzem źródłowym.

Zaplecze redakcyjne

Jak wykorzystać w tekście

gigantyczną skalę – można losować i losować nukleotydy, ale szansa, że trafią akurat w “wygrywającą kombinację” samopowielającego się genu, jest astronomicznie mała. Podsumowując, hipoteza RNA mimo swojej elegancji przesunęła tylko problem o krok: nawet jeśli pierwsze enzymy były z RNA, wciąż nie wyjaśniono wiarygodnie, skąd wzięło się tyle czystego RNA na start148. Sam

Słowa kluczowe

Projektowani v11; rozdział 17; przypis 148; yockey-information; opracowanie

Opublikowane głosy / osobny formularzMożesz też zaznaczyć fragment podczas lektury, dopisać komentarz i wysłać wszystkie uwagi razem.

PV11-149 — R17: Information Theory, Evolution, and the Origin of Life — przypis 149

Stały link do fiszki
Priorytet: BrakMiejsce: nieprzypisane

Czytam autora

Fragment źródłowy w kontekście

Hubert P. Yockery, Information theory, evolution, and the origin of life, op. cit., loc.
2119: “ This proposal for the origin of life is like a recipe for rabbit stew: First catch
the rabbit! It is no longer believed that the atmosphere of the early Earth was reducing,
at the time when life emerged, before 3,850 million years ago”

Lokalizacja w źródle

Projektowani v11, rozdział 17 „Początek życia”, s. 165, przypis 149

Rozumiem fragment

Ważne zastrzeżenie

Przed ostatecznym drukiem porównać cytat i numer strony z egzemplarzem źródłowym.

Zaplecze redakcyjne

Jak wykorzystać w tekście

przybyć z kosmosu, bo na Ziemi warunki były zbyt niesprzyjające – tak narodziła się koncepcja panspermii. Ale to już desperackie odsunięcie pytania w inną przestrzeń. Hipoteza RNA odpowiada na pewne pytania (np. “co było przed DNA?”), ale rodzi kolejne: “co było przed RNA?”. Jak ujęto to w pewnej publikacji, pomysł z RNA bywa “jak przepis na potrawkę z królika: na początku złap królika”149. Aby pierwsze RNA mogło działać, trzeba najpierw

Słowa kluczowe

Projektowani v11; rozdział 17; przypis 149; yockey-information; opracowanie

Opublikowane głosy / osobny formularzMożesz też zaznaczyć fragment podczas lektury, dopisać komentarz i wysłać wszystkie uwagi razem.