Pracownia poszukiwań
Sanford,2005-Genetic entropy
Pełny widok tekstowy: wszystkie sekcje są rozwinięte i znajdują się w jednym dokumencie HTML.
Opis bibliograficzny
Sanford, John C., Genetic Entropy, wyd. 4, FMS Publications (A Division of FMS Foundation), 2014. Rok określony na podstawie metryki © 2005, 2006, 2008, 2014 oraz aktualizacji opisanej w dodatku 6.
Zakres dostępnej kopii
289-stronicowa kopia PDF angielskiego e-booka, z licznikami „Loc” i postępu czytania. Metryka wskazuje wydanie czwarte i copyright do 2014 r.; nie jest to wyłącznie pierwsze wydanie z 2005 r. Spis obejmuje 11 rozdziałów, zakończenie, sześć dodatków, słownik, bibliografię i indeks. Liczby „Loc” nie są numerami stron druku. Opracowanie oparto na metryce, oryginalnym spisie i wskazanych fragmentach; nie sprawdzano każdego akapitu książki.
Streszczenie treści
Sanford rozwija koncepcję „entropii genetycznej”, według której narastanie szkodliwych mutacji prowadzi do pogarszania funkcjonowania genomu, a dobór naturalny nie potrafi skutecznie odwrócić tego procesu. Wyjaśnia własne rozumienie informacji genetycznej, rozważa częstość i skutki mutacji oraz ograniczenia selekcji wynikające z małych efektów pojedynczych zmian i biologicznego szumu. Polemizuje z proponowanymi mechanizmami ograniczającymi obciążenie mutacyjne i z przekonaniem o twórczej roli mutacji oraz selekcji. W czwartym wydaniu osobny rozdział omawia nowsze argumenty autora, w tym symulacje programu Mendel’s Accountant. Dodatki dotyczą między innymi złożoności genomu, duplikacji genów i reakcji środowiska akademickiego. Zakończenie łączy argumentację z osobistą deklaracją chrześcijańskiej nadziei. Książka jest źródłem stanowiska polemicznego w sporze o ewolucję, informację biologiczną i pochodzenie człowieka. Jej uogólnienia należy rozpoznawać jako tezy Sanforda, a przy opracowywaniu tematu zestawiać z badaniami genetyki populacyjnej i założeniami stosowanych modeli.
Hasła tematyczne
entropia genetyczna; obciążenie mutacyjne; dobór naturalny; genetyka populacyjna; informacja genetyczna; krytyka darwinizmu; mutacje; symulacje komputerowe; duplikacja genów; kreacjonizm; nauka i religia; antropologia biologiczna; nadzieja chrześcijańska
Spis treści
Foreward
Prologue
Chapter 1 The Genome is the Book of Life. Where did it come from? Newsflash - The genome is an instruction manual.
Chapter 2 Are Random Mutations Good? Newsflash - Mutations destroy information.
Chapter 3 How Much Mutation is Too Much? Newsflash - Human mutation rates too high.
Chapter 4 All-Powerful Selection to the Rescue? Newsflash - Selection capabilities very limited.
Chapter 5 Can Genomic Selection Problems be Solved? Newsflash - Selection cannot rescue the genome.
Chapter 6 A Closer Look at Noise Newsflash - Problems are much worse than you think.
Chapter 7 Artifical Rescue Mechanisms? Newsflash - Contriyed rescue mechanisms fail.
Chapter 8 Man to the Rescue? Newsflash - Eugenics/cloning can’t stop genomic degeneration.
Chapter 9 Can Natural Selection Create? Newsflash- Mutation/selection cannot create a single gene.
Chapter 10 Are the Downward Curves Real? Newsflash - All evidence points to genetic degeneration.
Chapter 11 Summary of Major New Scientific Developments. Newsflash - Case for genetic entropy now much stronger...
Postlude What Hope? Newsflash - There is a hope.
More Resources
Appendix 1A Deeply Entrenched Ideology
Appendix 2 How Many Nucleotides Can Effectively Be Selected at One Time?
Appendix 3 The Phenomenon of Unity and the Concept of Integrated Complexity
Appendix 4 Can Gene Duplication and Polyploidy Increase Genetic Information?
Appendix 5 Four Possible Objections
Appendix 6 How has Academia Responded to These Findings?
Glossary
References
Index
Fiszki (1)
AD-SAN-01 — Entropia genetyczna: kumulacja mutacji i granice doboru w ujęciu Sanforda
Stały link do fiszkiCzytam autora
Fragment źródłowy w kontekście
Sanford przedstawia entropię genetyczną jako zasadniczy kierunek zmian genomów, któremu sam proces mutacji i doboru naturalnego nie potrafi skutecznie przeciwdziałać. Pierwszy fragment jest pełnym hasłem z autorskiego słownika. Drugi pochodzi z rozdziału 11, gdzie autor opisuje wyniki symulacji wykonanych przy użyciu programu Mendel’s Accountant. To dwa odrębne miejsca książki.
1. Definicja entropii genetycznej — Glossary
Genetic entropy - The broad concept of entropy applies to biology and genetics. Apart from intelligent intervention, the functional genomic information within free-living organisms (possibly excluding some viruses) must consistently decrease. Like all other aspects of the real world we live in, the "natural vector" within the biological realm is degeneration, with disorder consistently increasing over time.
2. Wynik symulacji i ocena jej założeń — rozdział 11
The outcome of any particular simulation experiment depends on the exact biological circumstances that the user specifies. Using any set of biologically reasonable circumstances, genetic entropy (i.e., continuous deleterious mutation accumulation and subsequent fitness decline) is seen. Forward evolution is only observed using settings that are biologically very unrealistic.
Przekład całego fragmentu
Tłumaczenie własne z języka angielskiego, nie cytat z opublikowanego przekładu polskiego.
1. Definicja entropii genetycznej
Entropia genetyczna — Szerokie pojęcie entropii odnosi się do biologii i genetyki. Bez inteligentnej interwencji funkcjonalna informacja genomowa w organizmach wolno żyjących — być może z wyłączeniem niektórych wirusów — musi nieustannie się zmniejszać. Podobnie jak we wszystkich innych aspektach rzeczywistego świata, w którym żyjemy, „naturalnym wektorem” w dziedzinie biologicznej jest degeneracja, przy czym nieporządek stale narasta z upływem czasu.
2. Wynik symulacji i ocena jej założeń
Wynik każdego konkretnego eksperymentu symulacyjnego zależy od dokładnych warunków biologicznych określonych przez użytkownika. Przy zastosowaniu dowolnego zestawu biologicznie uzasadnionych warunków obserwuje się entropię genetyczną, to znaczy ciągłą akumulację szkodliwych mutacji i następujący po niej spadek dostosowania. Ewolucję postępującą naprzód obserwuje się jedynie przy ustawieniach bardzo nierealistycznych biologicznie.
Lokalizacja w źródle
John C. Sanford, Genetic Entropy, wydanie czwarte, FMS Publications, 2014. Pierwszy fragment: Glossary, hasło „Genetic entropy”, strona techniczna PDF 267, strona z oznaczeniem Loc 3190. Drugi fragment: rozdział 11, Summary of Major New Scientific Developments, część „Validation of Genetic Entropy using numerical simulation”, PDF 191, strona z oznaczeniem Loc 2141. Kontekst symulacji: PDF 190–192. Uzupełniające objaśnienie pojęcia entropii: rozdział 10, „2008 Update”, PDF 183–184.
Plik: Sanford,2005-Genetic entropy.pdf. Pomimo roku 2005 w nazwie, karta wydawnicza na PDF 3 wskazuje wydanie czwarte, z datami copyright do 2014 roku. Rok 2005 dotyczy pierwszego wydania, nie całej zawartości wykorzystanej tutaj kopii.
W polu „Strona techniczna pliku PDF” wpisać 267. Numery PDF nie są numerami stron wydania drukowanego. Oznaczenia Loc odczytano ze stopek stron; nie wyznaczają one dokładnych granic przytoczonych zdań. W cytatach scalono wyrazy podzielone między wierszami.
Rozumiem fragment
Teza mocniejsza niż samo istnienie szkodliwych mutacji
Sanford nie ogranicza się do stwierdzenia, że mutacje mogą szkodzić. Twierdzi, że funkcjonalna informacja całych genomów ulega długofalowej degradacji, a dobór naturalny nie potrafi zatrzymać tego procesu. W jego wywodzie skuteczność selekcji wobec niektórych zmian nie oznacza skuteczności w zachowaniu całego genomu.
Istotne miejsce zajmują mutacje o niewielkich skutkach. Autor argumentuje, że wiele z nich pozostaje poniżej progu skutecznego działania selekcji. Pojedynczo powodują małe zaburzenia, lecz ich nagromadzenie ma prowadzić do poważnego pogorszenia funkcjonowania organizmów. W rozdziale 11 uwzględnia też mutacje korzystne, ale ocenia ich udział jako niewystarczający do skompensowania zmian szkodliwych.
Co autor wyprowadza z symulacji
Opisany program modeluje powstawanie mutacji, rekombinację, rozmnażanie i selekcję kolejnych pokoleń. Sanford zaznacza, że wynik zależy od zadanych warunków, a następnie twierdzi, że warunki biologicznie realistyczne prowadzą do degradacji.
To rozróżnienie jest ważne: czym innym jest wynik obliczeń dla określonego zestawu parametrów, a czym innym ocena, które parametry adekwatnie opisują przyrodę. Cytat zawiera oba elementy. Określenie „biologicznie uzasadnione” wyraża ocenę autora; samo jego użycie nie zastępuje sprawdzenia założeń modelu.
Jak rozumie on „entropię”
W uzupełnieniu do rozdziału 10 Sanford łączy swoje pojęcie z fizycznymi procesami powstawania mutacji i niepełną skutecznością mechanizmów replikacji, naprawy oraz selekcji. Nie traktuje więc entropii genetycznej wyłącznie jako literackiego obrazu. Jednocześnie odróżnia funkcjonalną informację biologiczną od statystycznego pojęcia informacji Shannona, którego zastosowanie w tym kontekście krytykuje.
Ważne zastrzeżenie
Wybrane fragmenty dokumentują stanowisko Sanforda i jego interpretację symulacji; nie są samodzielnym potwierdzeniem wszystkich parametrów ani całej historycznej rekonstrukcji kondycji ludzkości. Ogólna teza autora wymaga oceny szerszej niż samo stwierdzenie, że występują szkodliwe mutacje.
Przytoczone miejsca nie ustalają genomu Adama, jego zdolności poznawczych ani przeżyć w stanie chwały. Nie zawierają też miary „entropii duszy”. Przeniesienie tego terminu do antropologii teologicznej trzeba oznaczyć jako własną analogię, a nie wynik symulacji genetycznej.
Zaplecze redakcyjne
Jak wykorzystać w tekście
Fiszka pozwala przedstawić własną tezę Sanforda przed podjęciem jej teologicznej interpretacji. Najwłaściwsza formuła brzmi: „Sanford argumentuje, że…”, a nie: „Genetyka wykazała, że…”. Dzięki temu czytelnik wie, kto odpowiada za generalizację dotyczącą nieuchronnej degradacji genomów.
Dla artykułu o Adamie książka może być punktem wyjścia do rozważenia biologicznego wymiaru pogorszenia kondycji człowieka. Połączenie tego wątku z utratą pierwotnej integralności pozostaje jednak osobnym krokiem interpretacyjnym. Należy wyłożyć jego przesłanki, zamiast zakładać tożsamość opisu genetycznego i teologicznego.